Мустафаев работает в МЧС с 1991 года. До увольнения в запас был начальником Главного управления МЧС по Московской области. В 2007 году стал фигурантом
расследования депутата Виктора Алксниса о приватизации военными земельных участков вдоль Рублево-Успенского шоссе: Мустафаеву выделила участок администрация Одинцовского района.